第一类是基于典型配送中心业务的应用系统。在销售物流中，如连锁超市的配送中心，在供应物流中，如制造企业的备件配送中心，都可以看到这样的案例。制药企业的现代物流中心就是这样一个典型的例子。
该体系的目标一是落实国家药品物流、GSP等相关管控标准，二是优化流程、提高效率。系统功能包括采购管理、库存管理、订单管理、拣货、审核、发货、射频终端管理、商品及库位基础信息管理等功能模块；通过网络化、数字化，提高仓库作业控制和任务安排水平。
该系统使交货时间缩短50%，订单处理能力提高一倍以上，取得了显着的社会效益，成为医药物流的典范。此类系统多用于制造或流通行业的供应链管理，也是最常见的WMS类型。
第二类是以仓储作业技术集成为主要目标的系统，解决各种自动化设备信息系统之间的集成和优化问题。武钢一号的生产物流信息系统，否则无法保持连续运行，不仅浪费生产力，而且浪费能源。
该系统的难点在于物流系统与轧钢线自动化设备系统的无缝连接，使库存成为装配线的流动环节，也使装配线成为库存的组成部分手术。各类特种设备都有自己的信息系统。 WMS不仅要集成设备系统，还要集成流程系统，还要集成到更大的整体企业信息系统中。
此类系统涉及的流程相对标准化和专业化，往往出现在大型erp系统中，并成为重要组成部分。
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